En una partida de Zapotec construyes Templos, Maizales y Aldeas en los tres valles que rodean la capital con el fin de generar los recursos necesarios para erigir Pirámides, ofrecer Sacrificios a los dioses y realizar Rituales. En cada ronda, los jugadores eligen simultáneamente una carta de su mano para determinar el orden de turno y los recursos que recolectan. Luego, realizan turnos individuales y gastan recursos para construir nuevas Casas, obtener acceso a habilidades especiales, ofrecer Sacrificios a los dioses y construir Pirámides. Después de 5 rondas, los jugadores obtienen puntos por las Pirámides, por su posición en el medidor de Sacrificios y por sus cartas de Ritual. El jugador que obtenga más Puntos de Victoria (PV) es declarado ganador.